氯吡格雷与奥美拉唑因竞争共同的肝药酶而避免联合应用，该肝药酶是A、CYP1A2B、CYP2E1C、CYP2D6D、CYP2C19E、CYP2B6

氯吡格雷属于二磷酸腺苷P2Y12受体阻断剂类抗血小板药。奥美拉唑、兰索拉唑属于质子泵抑制剂(PPI)，其可竞争肝药酶CYP2C9、cYP2C19而影响氯吡格雷代谢为有活性的产物，抵消氯毗格雷的心血管保护作用，降低疗效。因此氯吡格雷需联合使用PPI类药物时，应选择对肝药酶CYP2C9、CYP2C19几乎无影响的泮托拉唑或雷贝拉唑。他昔莫芬为调节体内激素平衡的药物，属于前药，主要在肝脏经肝药酶CYP2D6代谢，代谢为有活性的产物。吉非替尼属于酪氨酸激酶抑制剂，通过肝药酶CYP3A4代谢，诱导CYP3A4活性药可增加吉非替尼的代谢并降低其血药浓度和疗效。

临床证据显示：服用某些质子泵抑制剂（可竞争肝药酶CYP2C9、CYP2C19而影响氯吡格雷代谢为有活性的产物）会降低氯吡格雷的疗效，使得患者的血栓不良事件增加，但各类质子泵抑制剂的抑制作用并不相同，奥美拉唑、兰索拉唑对氯吡格雷的抑制作用最明显，泮托拉唑、雷贝拉唑的影响较弱或不明显。
美国和加拿大已经修改氯吡格雷的说明书，提示患者应避免合并使用奥美拉唑。正在使用氯吡格雷的患者如须使用质子泵抑制剂，应考虑使用不会产生强烈相互作用的药物，如泮托拉唑或雷贝拉唑。

氯吡格雷可能引发胃灼热和胃溃疡，合用质子泵抑制剂以防止或减轻相关症状。使用氯吡格雷者，如须使用PPI，应考虑不会产生强烈相互作用的药物，如泮托拉唑或雷贝拉唑。因为奥美拉唑、兰索拉唑会明显降低氯吡格雷的疗效（可竞争肝药酶CYP2C9、CYP2C19而影响氯吡格雷代谢为有活性的产物）。

应用氯吡格雷时慎用PPI，必要时改用对CYP2C19影响较小的雷贝拉唑、泮托拉唑，或组胺H受体阻断剂及胃黏膜保护剂米索前列醇、硫糖铝。