重庆谈判未能达成协议的问题是()。A.长期合作，坚决避免内战B.召开政治协商会议C.军队和解放区政权问题

本题考查“双十协定”的相关知识。《双十协定》是1945年10月10日，以毛泽东为首的中国共产党代表团与国民党政府代表在重庆谈判签署的，包括和平建国基本方针、军队国家化、国民大会、人民自由、政治民主化、党派合法化、特务机关、释放政治犯、地方自治、解放区地方政府、汉奸伪军、受降等十二个问题，这十二个问题中只有少数几条达成了协议，在军队、解放区政权这两个根本问题上没有达成协议。B项正确。

A项：召开政协会议在《双十协定》中达成了协议。与题干不符，排除。

C项：保证人民权利在《双十协定》中达成了协议。与题干不符，排除。

D项：和平建国，坚决避免内战在《双十协定》中达成了协议。与题干不符，排除。

抗战结束后，蒋介石采取了“假和平，真内战”的方针，于1945年8月14日、20日、23日连续三次电邀中共领袖毛泽东到重庆谈判。蒋介石这是为内战争取准备时间，如若毛泽东不来，则把内战的责任推给中国共产党。争取和平，揭露蒋反动派的假和平的阴谋，是毛泽东亲赴重庆谈判的首要目的。

《双十协定》列入关于和平建国的基本方针、政治民主化、国民大会、人民自由、党派合法化、特务机关、释放政治犯、地方自治、军队国家化、解放区地方政府、奸伪、受降等12个问题。这12个问题中仅少数几条达成协议，在军队、解放区政权两个根本问题上没有达成协议。即并没有承认解放区政权的合法地位，选B。

1946年6月26日，国民党以30万大军围攻中原解放区，全面内战爆发。故选B。