从运行的“目标”上比较农业生态系统和自然生态系统。

参考答案：自然生态系统物种多样性十分丰富，生物之间、生物与环境之间相互联系，相互制约，建立了复杂的食物链与食物网，形成了自然的自我调节稳定机制，保证自然生态系统相对稳定发展。农业生态系统的生物种类减少，食物链结构变短，农业生物对最佳环境条件依赖性不断增加，抗逆能力减弱，自然调节稳定机社制被削弱，系统的自我稳定性下降，因此，农业生态系统中需要人为的合理调节与控制才能维持其结构与功能的相对稳定性。例如：通过适当的人力、物力、资金等辅助能量的投入，实行“能量补给”，降低农业生物原采用于抗御逆境的自我维持活动的能量消耗，增加系统的稳定性，实现高产稳产。

参考答案：农业生态系统中的生物类群多数是按照人类的目的(如高产、优质、高抗等)驯化培育而来的，物质循环与能量转化能力得到进一步的加强和扩展，呼吸消耗降低，因而农业生态系统比同一地区的自然生态系统具有较高的生产力和较高的光能利用率。
除了强调农业生物自身的同化效率和积累能力所形成的自然生产力，农业生态系统更注重农业生物的经济生产力，即各种农业生物提供经济产量的能力。经济产量是人类干预生态系统的目标，表现为可以被人类利用的产品数量及其价值量的大小。经济生产力最终表现为纯收入的多少。这是自然生态系统所不具有的生产力特点。

参考答案：二者在结构和功能上的主要区别列于表中。

参考答案：自然生态系统的生物种类构成是在特定环境条件下，经过生物种群之间、生物与环境之间的长期相互适应形成的自然生物群落，具有特定环境下的生态优势种群和丰富的物种多样性。农业生态系统中最重要的生物品种是经过人工驯化培育的农业生物以及与之有关的生物。人类为了自身生存的需要，有意识、有目的地控制对人类无利用价值和对农业生物有害的生物，以便减少有害或无用生物对环境资源的竞争与消耗，使农业生态系统生物种类急剧减少，物种多样性降低。同时，人类自身数量的急剧增加，成为农业生态系统中最主要的消费成员。此外，农业生物种群与群落结构通常实行人工配置，农业生物个体生长和种群增长受人类的调控，个体生长速率加快，寿命缩短，种群密度增大，繁殖系数提高，同化资源的能力显著加强，有别于自然生物种群和群落结构。

参考答案：在自然生态系统中，初级生产者转化固定的能量只有5%～10%为草食者采食利用而进入草牧食物链，约90%以上的能量就地留下，储存于活的生物体内或有机残屑中，可供系统自我维持之用。在以生产农产品及其他生产、生活资料为目的农田生态系统中，其能量生产总量中被取走的部分可高达80%～90%，留下可用于系统自我维持的能量已很少。
农业生态系统与自然生态系统在能流特征上的差别，可在农业生产发展过程中充分地反映出来。