本题属于综合分析。
A项,两期比重比较。根据材料“2013年……研究与试验发展经费投入强度(与国内生产总值之比)为2.08%,比上年的1.98%提高0.1个百分点”,由部分增长率大于整体增长率则比重上升,可知研究与试验发展经费增速快于国内生产总值增速。故错误,排除;
B项,简单比较。根据材料“应用研究和试验发展经费占研究与试验发展经费总量的比重10.7%和84.6%”,可知试验发展经费占研究与试验发展总经费的比重不到九成。故错误,排除;
C项,基期量。根据材料“分活动类型看,全国用于基础研究的经费为555亿元,比上年増长11.3%”,基期量=现期量/(1+增长率),可得2012年基础研究经费为

亿元。故错误,排除;
D项,简单比较。根据材料“分地区看,研究与试验发展经费占全国比重前六名的为江苏(12.6%)、广东(12.2%)、北京(10%)、山东(9.9%)、浙江(6.9%)和上海(6.6%)。研究与试验发展经费投入强度达到或超过全国平均水平的有北京、上海、天津、江苏、广东、浙江、山东和陕西等8个省(市)”,可知,研究与试验发展经费投入强度达到或超过全国平均水平的8个省(市)中包括排名前六名的省市。故正确,当选。
因此,选择D选项。