10、多序列比对特别适合相似程度很小的序列进行比对。

题目

10、多序列比对特别适合相似程度很小的序列进行比对。

相似考题

1.蛋白质三级结构预测主要方法有实验方法、同源模建和从头预测3种。快速预测出一个蛋白质序列的结构，对目标序列进行BLAST和PSI-BLAST后，发现在已知结构的蛋白质中，最高的序列相似度为17%，你将选择的方法是A、二维凝胶电泳B、X射线晶体衍射技术C、磁共振谱技术D、将序列提交到蛋白质结构预测服务器进行同源模建E、将序列提交到蛋白质结构预测服务器进行从头预测用从头预测方法来获得蛋白质结构模型的特点是A、不能做小分子预测，计算量大B、适于对蛋白质核心结构进行预测，计算量小C、对序列相似度高的序列模拟比较有效，是最常用的一种方法D、基于分子动力学原理，寻找能量最低的构象E、基于同源比对原理，寻找能量最高的构象

2.关于序列比对的统计检验说法正确的是()。A、序列比对通过改变某些参数不可以得到不同比对结果B、序列比对的结果并不能作为两者之间一定存在同源关系的依据C、序列长度差异和字母表复杂度不会影响比对结果D、常用序列比对程序不会给出一些统计值表示结果的可信度

3.序列比对测定的是()。A、蛋白质B、核酸C、线粒体D、细胞

4.一般在获得一个新基因序列后，都需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。核酸序列的基础分析包括A、限制性酶切分析B、开放阅读框分析C、双序列比对分析D、多序列比对分析E、重复序列分析能够进行开放式读码框分析的软件是A、SequinB、ORF FinderC、ProfileScanD、FASTAE、Primer Premier 5.0

更多“10、多序列比对特别适合相似程度很小的序列进行比对。”相关问题

  • 第1题：

    北方区动保内部培训中所介绍的序列比对常用数据库是（）。

    • A、MCBI
    • B、NBCI
    • C、NICB
    • D、NCBI

    正确答案:D

  • 第2题：

    SIS系统可以进行哪几种比对（）

    • A、交叉比对
    • B、一对多比对
    • C、多多比对
    • D、排除比对

    正确答案:A,B,D

  • 第3题：

    什么样的序列作为密钥序列的话就很难被破译？（）

    • A、周期很大的拟完美序列
    • B、周期很小的拟完美序列
    • C、完美序列

    正确答案:A

  • 第4题：

    名词解释题
    多序列比对（multiple sequence alignment）

    正确答案： 三个或多个序列之间的比对，如果序列在同一列有相同结构位置的残基和（或）祖传的残基，则会在该位置插入空位。
    解析： 暂无解析

  • 第5题：

    单选题
    多序列比对工具是（）。
    A

    BLAST

    B

    ClustalW

    C

    Mega

    D

    GCG


    正确答案： B
    解析： 暂无解析

  • 第6题：

    问答题
    什么是多序列全局比对的累进算法？（三个步骤）

    正确答案： 第一，所有的序列之间逐一比对（双重比对）；
    第二，生成一个系统树图，将序列按相似性大致分组；
    第三，使用系统树图作为引导，产生出最终的多序列比对结果。
    解析： 暂无解析

  • 第7题：

    多选题
    影响原核生物基因启动子强弱的因素有（　　）。
    A

    －10序列与一致序列的吻合程度

    B

    －35序列与一致序列的吻合程度

    C

    －10序列与－35序列间隔区的长短

    D

    －10序列与－35序列间隔区的序列


    正确答案： A,B
    解析：
    －10序列与－35序列与一致序列的吻合程度，以及这两个序列之间间隔区的长短对启动子的强度同样重要。

  • 第8题：

    名词解释题
    序列比对（alignment）

    正确答案： 将两个或多个序列排在一起，以达到最大一致性的过程（对于氨基酸序列是比较他们的保守性），这样评估序列间的相似性和同源性。
    解析： 暂无解析

  • 第9题：

    填空题
    序列比对的基本思想，是找出（）和（）的相似性，就是通过在序列中插入（）的方法使所比较的序列长度达到一致。比对的数学模型大体分为两类，分别是（）和（）。

    正确答案： 检测基因,目标序列,空位,整体比对,局部比对
    解析： 暂无解析

  • 第10题：

    问答题
    在序列比对时DNA序列和蛋白质序列得分矩阵的意义有何不同？

    正确答案： 核酸序列得分系统比较简单，只需要考虑匹配、不匹配及空位罚分这三种情况；而蛋白序列比对就要复杂得多，除了考虑匹配和空位罚分外，对于不匹配的情形，要根据不同氨基酸的性质区别对待，可以为正分、负分及零分其基本依据是PAM矩阵或BLOSUM矩阵。
    解析： 暂无解析

  • 第11题：

    名词解释题
    多序列比对

    正确答案： 通过序列的相似性检索得到许多相似性序列，将这些序列做一个总体的比对，以观察它们在结构上的异同，来回答大量的生物学问题。P48，需要概括。
    解析： 暂无解析

  • 第12题：

    问答题
    给定一条序列，简述使用BLAST进行序列比对分析的策略

    正确答案： 1）获得查询序列，以FASTA格式黏贴到BLAST文本框中；
    2）选择一个BLAST程序（blastp，blastn，blastx，tblastx，tblastn）；
    3）选择一个用于搜索的数据库；
    4）为搜索和输出格式选择可选的参数；
    5）Search，结果分析。
    解析： 暂无解析

  • 第13题：

    一般在获得一个新基因序列后，都需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。核酸序列的基础分析包括（）

    • A、限制性酶切分析
    • B、开放阅读框分析
    • C、双序列比对分析
    • D、多序列比对分析
    • E、重复序列分析

    正确答案:A

  • 第14题：

    证明人类是单起源的方法是什么？（）

    • A、线粒体DNA序列比对
    • B、相貌比对
    • C、蛋白质比对
    • D、思维方法比对

    正确答案:A

  • 第15题：

    问答题
    MEGA2如何将其它多序列比对格式文件转化为MEGE格式的多序列比对文件？

    正确答案： （1）选择菜单file，
    （2）选择Text File Editor and Format Coverter工具，
    （3）调入需要转换的序列和相应的格式，
    （4）获得转换后的MEGA格式的文件并保存。
    解析： 暂无解析

  • 第16题：

    问答题
    什么是序列比对？及其基本分类？

    正确答案： 序列比对（Sequence Alignment）是通过在序列中搜索一系列单个性状或性状模式来比较2个（双序列比对）或更多（多重序列比对）序列的方法。
    序列比对的分类：
    A、双序列比对：两条序列的比对。
    B、多序列比对：三条或以上序列的比对
    解析： 暂无解析

  • 第17题：

    问答题
    简述序列比对两种类型。

    正确答案： （1）全局序列比：在全局范围内对两条序列进行比对打分的方法，适合于非常相似且长度近似相等的序列
    （2）局部序列比对：一种寻找匹配子序列的序列比对方法，适合于一些片段相似而另一些片段相异的序列
    解析： 暂无解析

  • 第18题：

    问答题
    什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵，它们的作用是什么，一般BLAST选择使用的矩阵是什么

    正确答案： PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵（scoring matrix）。记分矩阵中含有对齐时具体使用的数值。一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩阵供选择，若要进行突变性质的进化分析时可以使用PAM，FASTA缺省推荐BLOSUM50矩阵。
    PAM矩阵（Point Accepted Mutation）基于进化的点突变模型，如果两种氨基酸替换频繁，说明自然界接受这种替换，那么这对氨基酸替换得分就高。一个PAM就是一个进化的变异单位, 即1%的氨基酸改变，但这并不意味100次PAM后，每个氨基酸都发生变化，因为其中一些位置可能会经过多次突变，甚至可能会变回到原来的氨基酸。
    模块替换矩阵BLOSUM(BLOcks Substitution Matrix)首先寻找氨基酸模式，即有意义的一段氨基酸片断（如一个结构域及其相邻的两小段氨基酸序列），分别比较相同的氨基酸模式之间氨基酸的保守性（某种氨基酸对另一种氨基酸的取代数据），然后，以所有 60％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM60；以所有80％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM80。
    解析： 暂无解析

  • 第19题：

    名词解释题
    序列的比对

    正确答案： 是一种关于序列相似性的定性描述：在什么区域相似，在什么区域存在差别。最优比对：揭示两条序列的最大相似程度。（又叫序列联配，其意义在于从核酸、氨基酸的层次分析序列的相似性，推测其结构功能及进化上的联系，是基因识别、分子进化、生命起源研究的基础。
    解析： 暂无解析

  • 第20题：

    单选题
    一般在获得一个新基因序列后，都需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。核酸序列的基础分析包括（）
    A

    限制性酶切分析

    B

    开放阅读框分析

    C

    双序列比对分析

    D

    多序列比对分析

    E

    重复序列分析


    正确答案： B
    解析： 暂无解析

  • 第21题：

    问答题
    序列比对分类有哪些？

    正确答案： A、双序列比对：两条序列的比对
    B、多序列比对：三条或以上序列的比对
    解析： 暂无解析

  • 第22题：

    单选题
    证明人类是单起源的方法是什么？（）
    A

    线粒体DNA序列比对

    B

    相貌比对

    C

    蛋白质比对

    D

    思维方法比对


    正确答案： A
    解析： 暂无解析

  • 第23题：

    问答题
    什么是多序列全局比对的累进算法？

    正确答案： 第一，所有的序列之间逐一比对（双重比对）；
    第二，生成一个系统树图，将序列按相似性大致分组；
    第三，使用系统树图作为引导，产生出最终的多序列比对结果。
    解析： 暂无解析

  • 第24题：

    单选题
    什么样的序列作为密钥序列的话就很难被破译？（）
    A

    周期很大的拟完美序列

    B

    周期很小的拟完美序列

    C

    完美序列


    正确答案： A
    解析： 暂无解析

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