新型隐球菌用一般染色法难以着色，是因为其有A、荚膜B、鞭毛C、芽胞D、孢子E、菌丝

肺炎球菌的致病主要靠荚膜。白喉棒状杆菌菌体细长略弯，末端膨大呈棒状，常分散排列成"V"或"L"形，无菌毛、鞭毛和荚膜，不形成芽胞。革兰染色为阳性，用美蓝或奈瑟染色，在胞体内可见深染的异染颗粒。根据志贺菌的O抗原和分解甘露醇的能力，将其分为4群，即痢疾志贺菌（A群），福氏志贺菌（B群），鲍氏志贺菌（C群）和宋内志贺菌（D群）。该菌属的致病物质主要有菌毛、内毒素和外毒素。菌毛与其侵袭力有关。内毒素作用于肠黏膜，形成炎症和溃疡。志贺肠毒性外毒素具有霍乱毒素样功能，可引起水样腹泻。该菌属可引起急性及慢性细菌性痢疾。我国菌痢以福氏和宋内志贺菌引起感染较为多见。新生隐球菌为圆形的酵母型菌，外周有厚荚膜，折光性强。用墨汁负染后镜检，可见在黑色的背景中有圆形或卵圆形的透亮菌体，外包有一层透明的荚膜，荚膜比菌体大1～3倍。非致病的隐球菌则无荚膜。