一般采取负染后显微镜观察的是A、异染颗粒B、芽胞C、鞭毛D、荚膜E、菌毛

荚膜不易与碱性染料结合，故多采用负染的方法。因此本题最佳答案是D。

肺炎球菌的细菌结构中存在荚膜，且其主要的致病物质是肺炎球菌溶血素及荚膜。荚膜具有抗原性，是肺炎链球菌分型的依据。此菌可引起大叶性肺炎、脑膜炎、支气管炎等疾病

志贺菌属的致病物质主要有菌毛、内毒素和外毒素。菌毛与其侵袭力有关

细菌的特殊结构有荚膜、鞭毛、菌毛和芽胞。

在一定条件下，芽胞杆菌属（如炭疽杆菌）及梭状芽胞杆菌属（如破伤风杆菌、气性坏疽病原菌）能在菌体内形成一个折光性很强的不易着色小体，称为内芽胞，简称芽胞。芽胞一般只在动物体外才能形成，并受环境影响，当营养缺乏，特别是碳源、氮源或磷酸盐缺乏时，容易形成芽胞。其抵抗力强，对热力、干燥、辐射、化学消毒剂等理化因素均有强大的抵抗力，用一般的方法不易将其杀死。有的芽胞可耐100℃沸水煮沸数小时。杀灭芽胞最可靠的方法是高压蒸汽灭菌。当进行消毒灭菌时往往以芽胞是否被杀死作为判断灭菌效果的指标

荚膜菌在其细胞壁外有一层厚＞0.2μm而黏稠的结构称为荚膜，其化学成分在多数菌为多糖，少数菌为多肽。荚膜具有黏附宿主细胞和抗吞噬等致病作用以及抗原性，并且是鉴别细菌的指征之一

鞭毛在某些细菌菌体上具有细长而弯曲的丝状物，称为鞭毛。鞭毛的长度常超过菌体若干倍。在某些菌体上附有细长并呈波状弯曲的丝状物，少则1～2根，多则可达数百根。这些丝状物称为鞭毛，是细菌的运动器官