人民法院在审理行政案件，作为参照的是A、行政规章B、法律C、行政法规D、地方性法规E、自治条例

《行政诉讼法》第52条规定，人民法院审理行政案件，以法律和行政法规、地方性法规为 依据。地方性法规适用于本行政区域内发生的行政案件。人民法院审理民族自治地方的行政案件，并以该民族 自治地方的自治条例和单行条例为依据。第53条规定，人民法院审理行政案件，参照国务院部、委根据法律和 国务院的行政法规、决定、命令制定、发布的规章以及省、自治区、直辖市和省、自治区的人民政府所在地的市和 经国务院批准的较大的市的人民政府根据法律和国务院的行政法规制定、发布的规章。可见规章是用来参照 的，故选C项。

D
行政诉讼中，人民法院审理行政案件，可以参照规章。

该题考虑行政诉讼中的法律渊源，根据《行政诉讼法》第六十三条第一款与第三款的规定，法律、行政法规和相应区域的地方性法规，都是应当作为审理依据；而对于规章，则规定作为“参照”依据。因此选项C、D正确，选项A、B错误。综上，本题答案为：C、D。