Blast算法是一种基于全局序列比对的序列比对算法。
题目
Blast算法是一种基于全局序列比对的序列比对算法。
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第1题：
对比对称算法和公钥算法？
正确答案: 对称算法：速度快，主要用于数据加密，只有一个密钥。
公钥算法：速度较慢，主要用于数字签名和密钥交换，有两个密钥 -
第2题：
简述序列密码算法和分组密码算法的不同。
正确答案: 序列密码：
明文长度可以小于1字节，有记忆；加密不仅与密钥和明文有关，还与当前状态有关，也叫状态密码；设计关键在于密钥序列产生器，使生成的密钥序列尽可能高的不可预测性。
分组密码：
明文分成比较大的块，无记忆；每块使用相同的加密函数进行处理；增加记忆模块，形成一种序列密码；设计关键在于加解密算法，是明文密文之间的关联在密钥控制下尽可能复杂； -
第3题：
证明人类是单起源的方法是什么？（）
- A、线粒体DNA序列比对
- B、相貌比对
- C、蛋白质比对
- D、思维方法比对
正确答案:A -
第4题：
单选题按照密钥类型，加密算法可以分为（）。A.序列算法和分组算法
B序列算法和公用密钥算法
C公用密钥算法和分组算法
D公用密钥算法和对称密钥算法
正确答案： A解析： 暂无解析 -
第5题：
名词解释题多序列比对（multiple sequence alignment）正确答案： 三个或多个序列之间的比对，如果序列在同一列有相同结构位置的残基和（或）祖传的残基，则会在该位置插入空位。解析： 暂无解析 -
第6题：
单选题多序列比对工具是（）。ABLAST
BClustalW
CMega
DGCG
正确答案： B解析： 暂无解析 -
第7题：
问答题什么是多序列全局比对的累进算法？（三个步骤）正确答案： 第一，所有的序列之间逐一比对（双重比对）；
第二，生成一个系统树图，将序列按相似性大致分组；
第三，使用系统树图作为引导，产生出最终的多序列比对结果。解析： 暂无解析 -
第8题：
名词解释题序列的比对正确答案： 是一种关于序列相似性的定性描述：在什么区域相似，在什么区域存在差别。最优比对：揭示两条序列的最大相似程度。（又叫序列联配，其意义在于从核酸、氨基酸的层次分析序列的相似性，推测其结构功能及进化上的联系，是基因识别、分子进化、生命起源研究的基础。解析： 暂无解析 -
第9题：
问答题序列比对分类有哪些？正确答案： A、双序列比对：两条序列的比对
B、多序列比对：三条或以上序列的比对解析： 暂无解析 -
第10题：
单选题证明人类是单起源的方法是什么？（）A线粒体DNA序列比对
B相貌比对
C蛋白质比对
D思维方法比对
正确答案： A解析： 暂无解析 -
第11题：
名词解释题多序列比对正确答案： 通过序列的相似性检索得到许多相似性序列，将这些序列做一个总体的比对，以观察它们在结构上的异同，来回答大量的生物学问题。P48，需要概括。解析： 暂无解析 -
第12题：
单选题针对给定的HMM模型，寻找与给定观察字符序列对应的最佳状态序列可采用（）A前向算法；
B后向算法；
CViterbi算法；
DBaum-Welch算法
正确答案： C解析： 暂无解析 -
第13题：
Apriori算法是一种常见的（）。
- A、关联规则发现算法
- B、聚类分析算法
- C、分类算法
- D、序列模式发现算法
正确答案:A -
第14题：
按照密钥类型，加密算法可以分为（）。
- A、.序列算法和分组算法
- B、序列算法和公用密钥算法
- C、公用密钥算法和分组算法
- D、公用密钥算法和对称密钥算法
正确答案:D -
第15题：
公钥密码算法有效解决了对称密码算法的密钥分发问题，因此比对称密码算法更优。
正确答案:错误 -
第16题：
问答题MEGA2如何将其它多序列比对格式文件转化为MEGE格式的多序列比对文件？正确答案： （1）选择菜单file，
（2）选择Text File Editor and Format Coverter工具，
（3）调入需要转换的序列和相应的格式，
（4）获得转换后的MEGA格式的文件并保存。解析： 暂无解析 -
第17题：
问答题什么是序列比对？及其基本分类？正确答案： 序列比对（Sequence Alignment）是通过在序列中搜索一系列单个性状或性状模式来比较2个（双序列比对）或更多（多重序列比对）序列的方法。
序列比对的分类：
A、双序列比对：两条序列的比对。
B、多序列比对：三条或以上序列的比对解析： 暂无解析 -
第18题：
单选题Apriori算法是一种常见的（）。A关联规则发现算法
B聚类分析算法
C分类算法
D序列模式发现算法
正确答案： B解析： 暂无解析 -
第19题：
问答题什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵，它们的作用是什么，一般BLAST选择使用的矩阵是什么正确答案： PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵（scoring matrix）。记分矩阵中含有对齐时具体使用的数值。一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩阵供选择，若要进行突变性质的进化分析时可以使用PAM，FASTA缺省推荐BLOSUM50矩阵。
PAM矩阵（Point Accepted Mutation）基于进化的点突变模型，如果两种氨基酸替换频繁，说明自然界接受这种替换，那么这对氨基酸替换得分就高。一个PAM就是一个进化的变异单位, 即1%的氨基酸改变，但这并不意味100次PAM后，每个氨基酸都发生变化，因为其中一些位置可能会经过多次突变，甚至可能会变回到原来的氨基酸。
模块替换矩阵BLOSUM(BLOcks Substitution Matrix)首先寻找氨基酸模式，即有意义的一段氨基酸片断（如一个结构域及其相邻的两小段氨基酸序列），分别比较相同的氨基酸模式之间氨基酸的保守性（某种氨基酸对另一种氨基酸的取代数据），然后，以所有 60％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM60；以所有80％保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据，产生BLOSUM80。解析： 暂无解析 -
第20题：
填空题序列比对的基本思想，是找出（）和（）的相似性，就是通过在序列中插入（）的方法使所比较的序列长度达到一致。比对的数学模型大体分为两类，分别是（）和（）。正确答案： 检测基因,目标序列,空位,整体比对,局部比对解析： 暂无解析 -
第21题：
问答题在序列比对时DNA序列和蛋白质序列得分矩阵的意义有何不同？正确答案： 核酸序列得分系统比较简单，只需要考虑匹配、不匹配及空位罚分这三种情况；而蛋白序列比对就要复杂得多，除了考虑匹配和空位罚分外，对于不匹配的情形，要根据不同氨基酸的性质区别对待，可以为正分、负分及零分其基本依据是PAM矩阵或BLOSUM矩阵。解析： 暂无解析 -
第22题：
问答题对比对称算法和公钥算法？正确答案： 对称算法：速度快，主要用于数据加密，只有一个密钥。
公钥算法：速度较慢，主要用于数字签名和密钥交换，有两个密钥解析： 暂无解析 -
第23题：
问答题什么是多序列全局比对的累进算法？正确答案： 第一，所有的序列之间逐一比对（双重比对）；
第二，生成一个系统树图，将序列按相似性大致分组；
第三，使用系统树图作为引导，产生出最终的多序列比对结果。解析： 暂无解析 -
第24题：
问答题给定一条序列，简述使用BLAST进行序列比对分析的策略正确答案： 1）获得查询序列，以FASTA格式黏贴到BLAST文本框中；
2）选择一个BLAST程序（blastp，blastn，blastx，tblastx，tblastn）；
3）选择一个用于搜索的数据库；
4）为搜索和输出格式选择可选的参数；
5）Search，结果分析。解析： 暂无解析