假设两个蛋白质序列的相似度在20%左右,那么应该采用的PAM矩阵是?A.PAM60B.PAM80C.PAM120D.PAM250

题目

假设两个蛋白质序列的相似度在20%左右,那么应该采用的PAM矩阵是?

A.PAM60

B.PAM80

C.PAM120

D.PAM250


相似考题
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  • 第1题:

    什么是流动相似?两个流动相似应该满足什么条件?


    参考答案:流动相似是指两个流动对应点上的同名物理量具有各自的比例关系。包括几何相似、运动相似和动力相似以及初始条件和边界条件相似。

  • 第2题:

    假设A,B两个小区是邻区,都是低速小区,对应的Mcs取值为119,A小区的根序列索引为20,则以下哪些值可以配置为B小区的根序列素引?()

    a)33

    b)8

    c)38

    d)28

    e)13


    参考答案:ABC

  • 第3题:

    某饭店需要根据企业在市场上的竞争地位和市场的增长率这两个维度,把其所有业务划分为不同类型,以分析业务组合是否合理,并从总体上把握各项业务的作用,从而有选择地运用企业有限的资金。那么,该饭店应该采用的战略分析工具是( )。

    A.因素分析矩阵
      B.波士顿矩阵
      C.战略聚类模型
      D.价值链分析模型

    答案:C
    解析:

  • 第4题:

    在磁盘调度管理中,应先进行移臂调度,再进行旋转调度。假设磁盘移动臂位于21号柱面上,进程的请求序列如下表所示。如果采用最短移臂调度算法,那么系统的响应序列应为( )。

    A.②⑧③④⑤①⑦⑥⑨
    B.②③⑧④⑥⑨①⑤⑦
    C.①②③④⑤⑥⑦⑧⑨
    D.②⑧③⑤⑦①④⑥⑨

    答案:D
    解析:
    根据题干要求,先进行移臂调度,找到对应柱面。然后进行旋转调度,找到对应磁头和扇区。由表可知①⑤⑦在17柱面(21-17=4),②③⑧在23柱面(23-21=2),④⑥在32柱面(32-21=9)。因此按最短移臂算法,应该是23柱面→17柱面→32柱面→38柱面,只有D项满足。

  • 第5题:

    序列试验假设:()。

    • A、试验期自然降水量的空间分布在统计上是平稳的
    • B、作业区气候具有相似性
    • C、试验区自然降水量在时间分布是平稳的
    • D、试验区自然降水量均由相似的天气系统产生的

    正确答案:C

  • 第6题:

    “迷糊”先生在海南岛观星,天气突变,满天乌云,迷失了方向。不久云端露出一丝月光,“迷糊”先生隐约记得当天是农历九月十一日,此刻刚过子夜0时,于是根据月光判断出南方大致方位。这时朋友提醒当天是农历九月十三日,那么迷糊先生应该如何调整南方的方向()

    • A、将原来的“南方”向东偏转20度左右
    • B、将原来的“南方”向东偏转50度左右
    • C、将原来的“南方”向西偏转20度左右
    • D、将原来的“南方”向西偏转50度左右

    正确答案:C

  • 第7题:

    对于一个具有n个元素序列如果采用快速排序,那么所需的最少比较次数是(),所需的最大比较次数是(),且此序列为()序列。


    正确答案: nlog2n;n(n-1)/2;有序

  • 第8题:

    保护地黄瓜定植后的适宜温度()

    • A、白天控制在21度左右,夜间保持在10度左右。
    • B、白天控制在15度左右,夜间保持在13度左右。
    • C、白天控制在28度左右,夜间保持在20度左右。
    • D、白天控制在25度左右,夜间保持在15度左右。

    正确答案:D

  • 第9题:

    多选题
    下列关于波士顿矩阵的局限性说法正确的有()。
    A

    波士顿矩阵暗含了一个假设:企业市场份额与投资回报成正比

    B

    波士顿矩阵采用两个指标,每个指标仅有两个位级,过于简单

    C

    波士顿矩阵认为资金是企业的主要资源,但在企业内还有很多其他资源

    D

    用综合指标来测算产业吸引力,这些指标在不同产业的表现可能会产生不一致


    正确答案: A,D
    解析: 选项D属于通用矩阵的局限性。

  • 第10题:

    单选题
    关于同源蛋白质描述错误的是(  )。
    A

    同一基因进化而来的基因编码的蛋白质

    B

    同一基因编码的蛋白质

    C

    氨基酸序列相似

    D

    具有类似的生物学功能

    E

    同源蛋白质具有相似的空间构象


    正确答案: E
    解析: 暂无解析

  • 第11题:

    问答题
    在序列比对时DNA序列和蛋白质序列得分矩阵的意义有何不同?

    正确答案: 核酸序列得分系统比较简单,只需要考虑匹配、不匹配及空位罚分这三种情况;而蛋白序列比对就要复杂得多,除了考虑匹配和空位罚分外,对于不匹配的情形,要根据不同氨基酸的性质区别对待,可以为正分、负分及零分其基本依据是PAM矩阵或BLOSUM矩阵。
    解析: 暂无解析

  • 第12题:

    问答题
    简述PAM矩阵与BLUSUM矩阵的关系

    正确答案: (1)两者都在打分系统中使用对数比值;
    (2)PAM矩阵是基于近相关蛋白家族数据的,并且假设高度相关蛋白的取代概率可以外推到远相关蛋白的概率。BLOSUM矩阵是基于实际观测到的远相关蛋白比对。
    (3)高值BLOSUM矩阵和低值PAM矩阵最适合于研究高度保守的蛋白;低值BLOSUM矩阵和高值PAM矩阵最适合检测远相关蛋白。
    (4)一般来说,在局部相似性搜索上,BLOSUM矩阵较PAM要好。对于数据库搜索来说一般选择BLOSUM62矩阵。PAM矩阵可用于寻找蛋白质的进化起源,BLOSUM矩阵用于发现蛋白质的保守域。
    解析: 暂无解析

  • 第13题:

    相似的两个矩阵的秩一定相等。()


    参考答案:正确

  • 第14题:

    下列矩阵中能相似于对角矩阵的是:



    答案:C
    解析:




  • 第15题:

    假设磁盘臂位于15号柱面上,进程的请求序列如下表表示,如果采用最短移臂调度算法,那么系统的响应序列应为( )

    A.①②③④⑤⑥
    B.⑤①②④③⑥
    C.②③④⑤①⑥
    D.④②③⑤①⑥

    答案:B
    解析:
    采用最短移臂调度算法,磁盘臂当前在15号柱面,下一步应该移动到最近的12号柱面,其次是19号柱面、23号柱面、最后是28号柱面。对应的响应序列可以是⑤①②④③⑥。

  • 第16题:

    蛋白质三级结构预测主要方法有实验方法、同源模建和从头预测3种。快速预测出一个蛋白质序列的结构,对目标序列进行BLAST和PSI-BLAST后,发现在已知结构的蛋白质中,最高的序列相似度为17%,你将选择的方法是()

    • A、二维凝胶电泳
    • B、X射线晶体衍射技术
    • C、磁共振谱技术
    • D、将序列提交到蛋白质结构预测服务器进行同源模建
    • E、将序列提交到蛋白质结构预测服务器进行从头预测

    正确答案:E

  • 第17题:

    假设摄氏温度为40度,那么华氏温度应该是多少?


    正确答案: 104°F

  • 第18题:

    在蛋白质序列测定中必须先用()对蛋白质的多肽链进行部分水解成较小的肽段,才能进一步采用()法进行肽段的序列测定。


    正确答案:蛋白酶或化学试剂;Edman降解

  • 第19题:

    临界特质分析系统对工作进行挑选所采用的方法是()。

    • A、统计概率
    • B、特性参数
    • C、相似矩阵
    • D、职业矩阵

    正确答案:A

  • 第20题:

    两个集合经随机置换运算后得到的两个最小哈希值相等的概率=这两个集合的()。

    • A、余弦相似度
    • B、Pearson相关度
    • C、Jaccard相似度
    • D、欧式距离

    正确答案:C

  • 第21题:

    问答题
    什么是序列比对中使用的PAM矩阵和BLOSUM矩阵,它们的作用是什么,一般BLAST选择使用的矩阵是什么

    正确答案: PAM矩阵和BLOSUM矩阵都是用于序列相似性的记分矩阵(scoring matrix)。记分矩阵中含有对齐时具体使用的数值。一般FASTA和BLAST都提供BLOSUM或PAM系列矩阵供选择,若要进行突变性质的进化分析时可以使用PAM,FASTA缺省推荐BLOSUM50矩阵。
    PAM矩阵(Point Accepted Mutation)基于进化的点突变模型,如果两种氨基酸替换频繁,说明自然界接受这种替换,那么这对氨基酸替换得分就高。一个PAM就是一个进化的变异单位, 即1%的氨基酸改变,但这并不意味100次PAM后,每个氨基酸都发生变化,因为其中一些位置可能会经过多次突变,甚至可能会变回到原来的氨基酸。
    模块替换矩阵BLOSUM(BLOcks Substitution Matrix)首先寻找氨基酸模式,即有意义的一段氨基酸片断(如一个结构域及其相邻的两小段氨基酸序列),分别比较相同的氨基酸模式之间氨基酸的保守性(某种氨基酸对另一种氨基酸的取代数据),然后,以所有 60%保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据,产生BLOSUM60;以所有80%保守性的氨基酸模式之间的比较数据为根据,产生BLOSUM80。
    解析: 暂无解析

  • 第22题:

    单选题
    “迷糊”先生在海南岛观星,天气突变,满天乌云,迷失了方向。不久云端露出一丝月光,“迷糊”先生隐约记得当天是农历九月十一日,此刻刚过子夜0时,于是根据月光判断出南方大致方位。这时朋友提醒当天是农历九月十三日,那么迷糊先生应该如何调整南方的方向()
    A

    将原来的“南方”向东偏转20度左右

    B

    将原来的“南方”向东偏转50度左右

    C

    将原来的“南方”向西偏转20度左右

    D

    将原来的“南方”向西偏转50度左右


    正确答案: C
    解析: 暂无解析

  • 第23题:

    单选题
    临界特质分析系统对工作进行挑选所采用的方法是()。
    A

    统计概率

    B

    特性参数

    C

    相似矩阵

    D

    职业矩阵


    正确答案: C
    解析: 暂无解析

  • 第24题:

    名词解释题
    PAM矩阵

    正确答案: PAM指可接受突变百分率。一个氨基酸在进化中变成另一种氨基酸的可能性,通过这种可能性可以鉴定蛋白质之间的相似性,并产生蛋白质之间的比对。一个PAM单位是蛋白质序列平均发生1%的替代量需要的进化时间。
    解析: 暂无解析