参考答案和解析
正确答案: 受体模型的建立;小分子库的产生;计算机筛选和命中化合物的后处理。
第一步,受体模型的建立:
1.大分子结构获取:蛋白质结构的准备是虚拟筛选的重要一步。虚拟筛选的蛋白靶标的结构可以从PDB库(http://www.rcsb.org/pdb/index.html)中直接下载使用;也可以通过和家族中同源蛋白的序列、结构信息比较,同源模建而得。
2.接着是结合位点的描述,选择合适的配体结合口袋对分子对接至关重要。
第二步,建立小分子数据库:二维结构用结构转换程序如CORINA、CONCORD实现三维结构的转化。建好的三维结构加氢加电荷后,便可以用于对接程序。(剑桥小分子数据库,MDL数据库,天然产物数据库)
第三步,对接和打分,这一步是虚拟筛选的核心步骤。对接操作就是把每个小分子放到受体蛋白的配体结合位点,优化配体构像和位置,使之与受体有最佳的结合作用,给最佳结合构象打分,对所有化合物根据打分排序,然后从化合物库中挑出打分最高的小分子。
最后一步是命中化合物的后处理:通过计算分子的类药性质ADME/T(吸收absorption、器官分布distribution、体内代谢metabolism、排泄excretion和毒性toxicity)性质的估算,排除那些不具有类药性质的分子。可以利用一些经验规则如“五规则”等,快速排除那些不适合进一步药物开发的分子。
通过以上四步处理,大部分分子从化合物库中剔除,形成一个合理大小的化合物库,仅对这些适合成药的化合物或购买、或合成、或分离得到,然后再进行实际的生物测试。
更多“docking步骤是什么?”相关问题
  • 第1题:

    母线停电步骤是什么?
    (1)查母线上负荷所有负荷均已停电;
    (2)断开工作电源与备用电源的联锁开关;
    (3)断开工作电源开关,查母线电压为零;
    (4)将工作电源开关“远方/就地”切换开关切“就地”;
    (5)查工作电源开关在断位;
    (6)断开工作电源开关的控制电源开关;
    (7)将工作电源开关拉至检修位;
    (8)将备用电源开关“远方/就地”切换开关切至“就地”;
    (9)查备用电源开关在断位;
    (10)断开备用电源开关的控制电源开关;
    (11)将备用电源开关拉至检修位;
    (12)将母线PT停电。

  • 第2题:

    端口安全提供()。

    • A、Web安全
    • B、登录(login)控制
    • C、基于主机的访问控制
    • D、进出控制(ship docking)

    正确答案:D

  • 第3题:

    docking步骤是什么?


    正确答案: 受体模型的建立;小分子库的产生;计算机筛选和命中化合物的后处理。
    第一步,受体模型的建立:
    1.大分子结构获取:蛋白质结构的准备是虚拟筛选的重要一步。虚拟筛选的蛋白靶标的结构可以从PDB库(http://www.rcsb.org/pdb/index.html)中直接下载使用;也可以通过和家族中同源蛋白的序列、结构信息比较,同源模建而得。
    2.接着是结合位点的描述,选择合适的配体结合口袋对分子对接至关重要。
    第二步,建立小分子数据库:二维结构用结构转换程序如CORINA、CONCORD实现三维结构的转化。建好的三维结构加氢加电荷后,便可以用于对接程序。(剑桥小分子数据库,MDL数据库,天然产物数据库)
    第三步,对接和打分,这一步是虚拟筛选的核心步骤。对接操作就是把每个小分子放到受体蛋白的配体结合位点,优化配体构像和位置,使之与受体有最佳的结合作用,给最佳结合构象打分,对所有化合物根据打分排序,然后从化合物库中挑出打分最高的小分子。
    最后一步是命中化合物的后处理:通过计算分子的类药性质ADME/T(吸收absorption、器官分布distribution、体内代谢metabolism、排泄excretion和毒性toxicity)性质的估算,排除那些不具有类药性质的分子。可以利用一些经验规则如“五规则”等,快速排除那些不适合进一步药物开发的分子。
    通过以上四步处理,大部分分子从化合物库中剔除,形成一个合理大小的化合物库,仅对这些适合成药的化合物或购买、或合成、或分离得到,然后再进行实际的生物测试。

  • 第4题:

    麦芽汁的制备工艺是什么?关键步骤是什么?


    正确答案:麦汁制造是将固态麦芽、非发芽谷物、酒花用水调制加工成澄清透明的麦芽汁的过程。
    麦汁制造过程包括:原料的粉碎、糖化,糖化醪的过滤,混合麦汁加酒花煮沸,麦汁处理—澄清、冷却、通氧等一系列物理学、化学、生物化学的加工过程。
    关键步骤是原料的糖化过程。

  • 第5题:

    PCR原理是什么?其基本步骤如何?解释各步骤的目的。


    正确答案:类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与靶序列两端互补的寡核苷酸引物。
    PCR由变性--退火--延伸三个基本反应步骤构成:
    ①模板DNA的变性:模板DNA经加热至93℃左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链,以便它与引物结合,为下轮反应作准备;
    ②模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55℃左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;
    ③引物的延伸:DNA模板--引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA链互补的半保留复制链;重复循环变性--退火--延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”。

  • 第6题:

    ()allows a laptop to connect to other devices such as monitor, printer, etc.

    • A、Docking station
    • B、Switch
    • C、Router
    • D、Hub

    正确答案:A

  • 第7题:

    单选题
    制订工具栏时哪两个选项必须再重新启动UG软件的条件下才能生效,其他选项再制订时立即生效。()
    A

    Icon Size和Color Icon

    B

    Cue/Status Position和Docking Priority

    C

    Icon Size和Cue/Status Position

    D

    Color Icon和Docking Priority


    正确答案: B
    解析: 暂无解析

  • 第8题:

    单选题
    Which one of the following repair will cost the least cost?()
    A

    Routine docking repair

    B

    Voyage repair

    C

    Damage repair

    D

    Conversion


    正确答案: B
    解析: 暂无解析

  • 第9题:

    问答题
    计划的步骤计划的步骤是什么?

    正确答案: 计划的步骤可分为以下八个阶段:
    (1)分析形势。
    (2)确定目标。
    (3)评估资源。
    (4)拟定备选方案。
    (5)比较方案。
    (6)选定方案。
    (7)制定辅助计划。
    (8)编制预算。(计划预算)
    解析: 暂无解析

  • 第10题:

    问答题
    简述何谓交通规划,交通规划的总体设计包括哪些内容?何谓四步骤模型,每个步骤的主要工作是什么,每个步骤预测成果是什么?

    正确答案: 交通规划:是有计划的引导交通的一系列行动,即规划者如何提示各种目标,又如何将提示的目标付诸实施的方法。
    交通规划的总体设计内容包括:
    1)建立组织机构
    2)目标制定
    3)交通系统的调查与分析,相关现象的调研
    4)相关基本模型分析
    5)交通需求预测
    6)方案的制定
    7)方案的综合评价
    8)推荐方案
    9)方案实施过程中的反馈和修改
    四步骤模型:交通发生于吸引、交通分布、交通方式划分、交通流分配
    1)交通的发生和吸引的任务是求出对象区域的交通需求总量,即生成交通量,然后在此量的约束下,求出各个交通小区的发生和吸引交通量。预测成果是OD表中的小计行和小计列。此时的OD表可以分为客运OD表和货运OD表。
    2)交通分布预测的任务是在目标年各交通小区的发生和吸引交通量一定的条件下,求出各交通小区之间的将来OD交通量(分布交通量)。预测成果是完整的OD表。也分为客运OD表和货运OD表。
    3)交通方式划分预测的任务是预测目标年出行者选择交通工具的比例,从而得各种交通方式的OD交通量。预测成果是各种交通方式的OD表。如:小汽车OD表、公交车OD表、轨道交通OD表等。
    4)交通分配的任务是是将预测得出的OD交通量,根据已知的道路网描述,按照一定的规划符合实际地分配到路网中的各条道路上去,进而求出路网中各路段的交通流量、所产生的OD费用矩阵,并所此对交通网络的使用状况做出分析和评价。预测成果是各路段的交通流量。
    解析: 暂无解析

  • 第11题:

    实地抽样的步骤是什么?
    首先是训练抽样人员。无论是自填问卷,还是调查访问,实际抽取调查对象的工作量都很大,而且具有一定的技术难度,因此需要对有关人员进行专门训练。其次,与抽样方案中的各级抽样单位取得联系。
    第三,具体执行抽样工作。在进行正式抽样时,抽样员应携带由调查单位出具的各种身份证明文件或抽样员聘书,到各级抽样单位进行抽样。第四,检查样本的正确性。抽样员完成抽样工作后,督导人员应该对样本的正确性进行检查。

  • 第12题:

    计划的步骤计划的步骤是什么?


    正确答案: 计划的步骤可分为以下八个阶段:
    (1)分析形势。
    (2)确定目标。
    (3)评估资源。
    (4)拟定备选方案。
    (5)比较方案。
    (6)选定方案。
    (7)制定辅助计划。
    (8)编制预算。(计划预算)

  • 第13题:

    英译中:Cross docking


    正确答案: 直接换装

  • 第14题:

    决策步骤是什么?


    正确答案: 1)明确问题;
    2)设立目标;
    3)收集整理信息;
    4)拟定可供选择方案;
    5)分析、比较各个可行方案;
    6)选择方案进行决策;
    7)组织决策方案的实施;
    8)检验决策实施的效果。

  • 第15题:

    MM4系列变频器的调试步骤分几个步骤,各是什么,每步作用是什么?


    正确答案:3个步骤,即参数复位调试、快速调试和功能调试。参数复位是将变频器参数恢复到出厂状态下的默认值操作;快速调试是指通过设置电动机参数、斜坡函数参数和变频器的命令源及频率给定源等参数,从而达到简单、快速运转电机的一种调速方式。功能调试是指用户按照具体生产工艺需要进行的设置操作。

  • 第16题:

    You are the network administrator for ExamSheet.net.  You install Windows 2000 Professional on your portable computer. You use a docking station for your portable computer when you are in the office. You install a ISA-based network adapter in your docking station. You insert your computer into the docking station and start the computer. The network adapter is not detected during the startup process. You obtain a disk that contains the supported driver from the network adapter manufacturer. You want to allow Windows 2000 Professional to use the network adapter. What should you do?()

    • A、Restart the computer in the docking station.
    • B、Run the Add/Remove Hardware wizard.
    • C、Use Device Manager to scan for hardware changes.
    • D、Copy the network adapter driver to the Winnt/Driver Cache/i386 folder.
    • E、Install the new network adapter driver.

    正确答案:B,E

  • 第17题:

    单选题
    To ensure the quality of dock repair, C/E should know very well ()
    A

    the repair standard of main docking repair item

    B

    the special tool for repair item

    C

    the skill of repairer

    D

    the status of docking repair equipment


    正确答案: C
    解析: 暂无解析

  • 第18题:

    问答题
    docking步骤是什么?

    正确答案: 受体模型的建立;小分子库的产生;计算机筛选和命中化合物的后处理。
    第一步,受体模型的建立:
    1.大分子结构获取:蛋白质结构的准备是虚拟筛选的重要一步。虚拟筛选的蛋白靶标的结构可以从PDB库(http://www.rcsb.org/pdb/index.html)中直接下载使用;也可以通过和家族中同源蛋白的序列、结构信息比较,同源模建而得。
    2.接着是结合位点的描述,选择合适的配体结合口袋对分子对接至关重要。
    第二步,建立小分子数据库:二维结构用结构转换程序如CORINA、CONCORD实现三维结构的转化。建好的三维结构加氢加电荷后,便可以用于对接程序。(剑桥小分子数据库,MDL数据库,天然产物数据库)
    第三步,对接和打分,这一步是虚拟筛选的核心步骤。对接操作就是把每个小分子放到受体蛋白的配体结合位点,优化配体构像和位置,使之与受体有最佳的结合作用,给最佳结合构象打分,对所有化合物根据打分排序,然后从化合物库中挑出打分最高的小分子。
    最后一步是命中化合物的后处理:通过计算分子的类药性质ADME/T(吸收absorption、器官分布distribution、体内代谢metabolism、排泄excretion和毒性toxicity)性质的估算,排除那些不具有类药性质的分子。可以利用一些经验规则如“五规则”等,快速排除那些不适合进一步药物开发的分子。
    通过以上四步处理,大部分分子从化合物库中剔除,形成一个合理大小的化合物库,仅对这些适合成药的化合物或购买、或合成、或分离得到,然后再进行实际的生物测试。
    解析: 暂无解析

  • 第19题:

    单选题
    A large basin cut into the shore,closed off by a caisson,and used for dry docking of ships is known as a().
    A

    slipway

    B

    graving dock

    C

    ground warp

    D

    caisson dock


    正确答案: C
    解析: 暂无解析

  • 第20题:

    名词解释题
    docking protein, DP (停靠蛋白)

    正确答案: 即SRP在内质网膜上的受体蛋白,它能够与结合有信号序列的SRP牢牢地结合,使正在合成蛋白质的核糖体停靠到内质网上来。停靠蛋白含有两个亚基,一个亚基暴露于细胞质的亲水部分,由640个氨基酸组成;另一个亚基是嵌入膜内的疏水部分,由300个氨基酸所组成。SRP受体蛋白除了同SRP结合将核糖体引导到内质网,同时,它的α亚基与SRP一起催化GTP水解释放能量,帮助信号肽转位。
    解析: 暂无解析